Hakuo Gakuin costumava ser uma prestigiada escola de alta classe e era famoso por artes marciais.Ultimamente vários alunos estão se transferindo para a Academia Seishikan , os melhores alunos que ainda continuão a estudar em Hakuo Gakuin andam sofrendo misteriosos atentados e para piorar alunos de Seishikan ficam amedrontando e ameaçando os alunos de Hakuo para se transferirem..A fim de recuperar da situação, o diretor em exercício da Hakuo, Himeko Hojo, envia Yagyu Ranko para aldeia Fuuma em busca do famoso clã ninja Fuma para assistência. O líder dos Fuma envia Kojiro para Hakuo. Lá ele enfrenta o notório Yasha clã, que luta por Seishikan, liderada por Asuka Musashi. Logo camaradas de Kojiro chegam e uma guerra ninja a começa entre os dois clãs.